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Virologica Sinica, 32 (6) : 511, 2017
Research Article
2016至2017年巴基斯坦基孔肯亚病毒的检测、分离和鉴定
1. 中国科学院武汉病毒研究所
2. 中国科学院大学
3. 东北农业大学
4. Centre of Excellence in Science and Applied Technology, Islamabad 44000, Pakistan
 Correspondence: zhangbo@wh.iov.cn
(8691.50KB)  
摘要
基孔肯亚病毒(chikungunya virus,CHIKV)是蚊媒传播的甲病毒属病毒,2005-2006年在印度洋地区大流行后又在非洲、亚洲和欧洲等地感染了数百万人。2016年11月中旬以来,巴基斯坦已确诊了4000多个CHIKV感染病例。本研究首次报道了来自于巴基斯坦CHIKV病毒疫情的CHIKV病毒分离和鉴定。通过细胞培养的方法从病人血清样本中分离得到8株CHIKV病毒。我们对CHIKV进行测序后得到1条全长基因组和8条E1基因序列。通过序列比对发现,8株CHIKV的E1序列同源性很高,在E1保守的基因位点上仅发现2个非同义突变(E99和Q235)。这两个突变位于E1的功能区域,如与细胞融合和传播媒介特异性有关的结构域。本研究不仅阐明了巴基斯坦CHIKV流行病的情况,而且为南亚地区CHIKV的进化和传播提供了重要的研究基础。
Received: 4 Sep 2017  Accepted: 12 Dec 2017  Published online: 21 Dec 2017
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