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PLOS Pathog |南京师范大学韩管助课题组在逆转录病毒进化方面取得新进展
at :2018/6/21 10:38:33    

近日,南京师范大学韩管助教授课题组在微生物学领域权威期刊PLOS Pathogens发表了题为“Endogenous retroviruses of non-avian/mammalian vertebrates illuminate diversity and deep history of retroviruses”的论文,报道了在逆转录病毒多样性和远古进化方面取得的研究进展。

文章链接:

http://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1007072

 

 

逆转录病毒感染脊椎动物,可引发多种疾病(如艾滋病和癌症)。目前对于逆转录病毒的远古史和早期进化仍所知甚少。而逆转录病毒可以整合到宿主基因组中形成内源性逆转录病毒。内源性逆转录病毒记录了过去发生的感染事件,因此为研究逆转录病毒的远古进化提供了重要的“分子化石”。古病毒学(paleovirology)是一门新兴的学科,主要是通过病毒“分子化石”来研究病毒的远古进化以及远古病毒对宿主生物学的影响。

 

南京师范大学韩管助教授课题组设计了一种能够更加灵敏地挖掘内源性逆转录病毒的新策略,并利用该策略在92种脊椎动物(其中包括72种鱼类、4种两栖类和16种爬行类)基因组中共挖掘到了8000余条内源性逆转录病毒,揭示了内源性逆转病毒普遍存在于有颌类脊椎动物基因组中该研究重建了450条逆转录病毒全基因组或部分基因组一致序列,为研究逆转录病毒进化和分类提供了重要的资源。系统发生分析表明逆转录病毒可分为五个主要支系,分别被命名为“金”、“木”、“水”、“火”和“土”逆转病毒支系。该研究详细地探讨了这五个病毒支系的宿主范围和进化图1。宿主和病毒系统发生关系一致性检测表明逆转录病毒(除泡沫病毒外)经历了频繁的跨宿主传播事件。该研究还发现水陆界面并不是逆转录传播的一个严格屏障,感染陆生脊椎动物的逆转录病毒可能为多次独立起源。这项研究在很大程度上丰富了我们对于逆转录病毒多样性、分类系统和远古进化的理解。

 

图1 “金”、“木”、“水”、“火”、“土”五个逆转病毒支系的宿主范围和进化

 

这项研究被PLOS Pathogens选为Featured Research Article。南京师范大学2015级硕士研究生许晓雨为该论文的第一作者,韩管助教授为该论文的通讯作者。相关研究得到了国家自然科学基金、江苏省基础研究计划、江苏省优势学科建设项目等的支持。

 

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